El 11 de julio de 1914 Martín Tornquist presentó una carta ante el Director de Salubridad, con los antecedentes para la fundación de la Colonia Verónica. En 1957 un grupo de vecinos planteó la necesidad de dividir el partido de Magdalena y crear el que se denominaría Coronel de Marina Tomás Espora, lo que fue aprobado por las cámaras legislativas. Las iniciativas se retomaron en 1994 y culminaron con la creación del partido de Punta Indio.

El 6 de diciembre de 1994 consiguió su autonomía con la promulgación de la Ley Provincial que dividió al entonces partido de Magdalena. Asumieron sus primeras autoridades el 10 de diciembre de 1995 lo que lo convierten en uno de los partidos más nuevos de la provincia.