Debe su actual nombre a Manuel Isidoro Suárez, coronel del Ejército Argentino, que luchó en las guerras de independencia hispanoamericana, dirigiendo la caballería peruana y colombiana en la batalla de Junín en Perú cuando tenía 24 años.. Es creado el 10 de Julio de 1882 durante la gobernación de Dardo Rocha por Ley 1497. Por ley 2829 del 28 de mayo de 1883, se funda el pueblo de Coronel Suárez en el distrito para darle impulso a la incipiente actividad agrícola que comenzaba a desarrollarse y que luego sería característica de la región.